Bộ môn Toán có nhiệm vụ giảng dạy học phần Xác suất - Thống kê Y học, Xác suất – Thống kê Y học nâng cao (bao gồm lý thuyết và thực hành) cho các đối tượng sinh viên của các khoa trực thuộc ĐHYD. Trong các năm qua Bộ môn Toán là một trong những bộ môn có nhiều đề tài NCKH cấp cơ sở được nghiệm thu hàng năm, có ít nhất 2 bài báo được đăng trên tạp chí Quốc tế (ISI, Scopus) hàng năm và các đề tài báo cáo khoa học trong Hội nghị Khoa học Kỹ thuật hàng năm của Đại học Y Dược Tp.HCM.
Bộ môn Toán phấn đấu đạt chuẩn đầu ra như sau: Hiểu và áp dụng được các kiến thức Xác suất - Thống kê khi học các môn chuyên ngành Y Dược; ứng dụng Xác suất - Thống kê trong các nghiên cứu khoa học chuyên ngành Y Dược